В отличии от пункционной биопсии, во время которой небольшое количество тканей берется при помощи иглы, забор фрагмента (кусочка) опухоли делает трепан-биопсию более информативным методом диагностирования онкологического заболевания. Гистологический анализ изъятого до начала лечебных мероприятий образца позволяет углубленно изучить клеточную структуру образования, произвести гистохимические исследования, обнаружить эстрогенорецепторы, половые хроматины и другие, более глубокие структуры.